Ubicada en las instalaciones del Museo de la Autonomía de Andalucía, la Biblioteca tiene un fondo bibliográfico especializado en el proceso autonómico andaluz, cubriendo desde los inicios del andalucismo histórico, con Blas Infante, hasta la actualidad. 

Asimismo, dispone de un fondo especializado en ciencias sociales, que sirve como apoyo a la labor investigadora que se lleva a cabo en el Centro de Estudios Andaluces. 

En el espacio de la biblioteca también se custodian diversos fondos archivísticos como la documentación relacionada con Blas Infante que se conservaba en la Casa de la Alegría o el fondo del americanista Enrique Otte que reúne su biblioteca y archivo personal.